通常在人体鼻咽部有正常菌群定植，如常见的溶血和非溶血链球菌、肺炎链球菌、奈瑟球菌属类、白喉杆菌等。细菌可通过高声说话、打喷嚏、咳嗽、飞沫等方式定植到上呼吸道。
细菌能否进入机体内导致疾病发生，主要取决于宿主的状态和免疫功能。健康人群一般可通过皮肤的天然屏障将细菌拒之门外。对于少量细菌，正常人群可启动细胞免疫和体液免疫功能。所以，对于健康人群，细菌性肺炎通过呼吸道传染的概率非常小。但对于免疫功能低下人群，细菌容易通过机体的三道天然屏障，导致细菌肺炎发生。糖尿病、慢性阻塞性肺疾病、肾病、肿瘤等慢性病，会导致机体免疫力下降。正常人群经常熬夜劳累、精神紧张、过度节食，也会导致机体免疫力下降，增加细菌性肺炎发病率。
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