通过基因工程技术将一种或几种外源性基因转移到某种特定的生物体中，并使其有效地表达出相应的产物，此过程叫转基因。以转基因生物为原料加工生产的食品就是转基因食品。根据转基因食品来源的不同可分为植物性转基因食品，动物性转基因食品和微生物性转基因食品。目前为止没有明确的证据表明转基因食品对人体有害。因为转基因多用的核酸等物质都是自然界存在的，我们经常使用的生物体内的一些元素成分。也就是说科学家利用现成的物质，在不同物种之间或者不同个体间转移，从而让转基因生物体表现出特殊的特征或优势。自转基因食品问世以来，全球约有2亿多人食用过数千种转基因食品，尚未报道过一例食品安全事件。
但是对于转基因所用的载体病毒或者是质粒，可能会存在一定的使用安全问题，目前的科技水平下还比较难准确评估转基因载体病毒的危害性。食物链中有益物质的富集或有害物质的集聚对上一级生物的健康极为关键，转基因农作物大多用于饲料，这类转基因食物转入本身没有的抗病虫害基因或抗杂草基因，其本体会有哪些富集变化，被家畜富集后又会怎样，生物链最终端的人类食用后会又可能会产生什么影响等问题尚缺少全面系统的科研结论。
此外，转基因生物具有自然生物所不具备的优势，若被释放到环境中，可能造成原有的生态平衡被打破，改变物种间的竞争关系，长期不利于生态安全，但是否有这样的生态安全威胁，目前也还没有很好的科学证据。
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