抽脑脊液虽然是一种有创的检查方式，但是不会产生什么后遗症。脑脊液穿刺一般是在腰3~4间隙之间穿刺，不会造成中枢神经系统的损伤。只是有一部分患者对于疼痛的耐受性比较差，抽了脑脊液之后1~2天可能局部会存在疼痛不适，可是不用特殊处理，可以自然缓解。
小部分患者会有感染的风险，但是几率非常低，因为脑脊液穿刺是在无菌的状态下进行，感染可能与自身免疫力低下、护理不当有关系。做脑脊液穿刺时要尽量配合医生操作，摆好体位，穿刺完毕去枕平卧位6小时，局部避免受潮，绝大多数人对身体没有影响。
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