流产的原因非常多，占最大比例是来自于胎儿的因素，胎儿染色体异常自然流产原因的60%到70%。如果母亲在怀孕期间有严重感染，有过上呼吸道感染或病毒感染，肝功能异常及孕妇有严重的贫血、高血压等情况，都可能会造成流产。
如果母亲有双子宫、子宫纵膈、双角子宫，以及严重的子宫腺肌症，巨大的子宫肌瘤等生殖器官畸形的情况，都可能会造成流产。
母亲体内内分泌异常，比如卵巢功能不好，黄体功能不好，孕酮比较低以及内分泌器官的疾病，比如甲状腺功能的异常等，或糖尿病，造成自然流产的可能性也比较多。
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