肝内胆管结石本质上也属于胆管结石的一个类型，它可以根据不同的累及范围，表现成不同的症状。有一些肝内胆管结石，它可能会累及到一叶或者一段的肝脏，导致这一叶或者一段的肝脏出现萎缩，主要原因还是结石阻塞了胆管所引流的那一段或者叶的肝脏以后，导致肝细胞或者肝组织出现了萎缩。同时因为结石的存在还会引起一些胆道相关的一个症状，比如出现胆管炎病人可以表现成发烧、寒颤、高热、腹痛，甚至会引起肝脏酶学的改变，包括转氨酶的升高，胆红素的升高，胆道酶的升高，这都是肝内胆管结石合并有胆管炎以后出现的临床表现。另外还有一个就是肝内胆管结石它还是肝脓肿的一个好发因素。
对于肝内胆管结石的病人，一旦形成胆管炎，可能会在感染的部位逐渐发展加重形成肝脓肿。所以对于肝内胆管结石患者，一旦有症状，有过胆管炎的发作，要及时的治疗，而治疗的办法要根据胆管结石累积的范围来做相应的选择，比如局限在一叶或者一段可以做肝切除；而弥漫性的肝内胆管结石就没有办法做肝切除，可以考虑做胆管的胆道镜的取石。
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