小儿再生障碍性贫血的发病可能和下列因素有关：
1、药物
药物是最常见的发病因素。
2、化学毒物
苯及其衍化物和再生障碍性贫血的关系已为许多实验研究所肯定。苯进入人体，易固定于富含脂肪的组织。慢性苯中毒时，苯主要固定于骨髓。苯中毒再生障碍性贫血可呈慢性型，也可呈急性严重型，但以后者居多。
3、电离辐射
X线、γ线或中子可穿过或进入细胞，直接损害造血干细胞和骨髓微环境。长期超允许量放射线照射（如放射源事故）可致本病。
4、病毒感染
病毒性肝炎和再障的关系已较肯定，称为病毒性肝炎相关性再障，是病毒性肝炎最严重的并发症之一。肝炎病毒对造血干细胞有直接抑制作用，还可致染色体畸变。
5、免疫因素
再障可继发于胸腺瘤、系统性红斑狼疮和类风湿性关节炎等，患者血清中可找到抑制造血干细胞的抗体。
6、遗传因素
Fanconi贫血系常染色体隐性遗传性疾病，有家族性。
7、阵发性睡眠性血红蛋白尿（PNH）
小儿再生障碍性贫血PNH和再障关系相当密切。
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