南京市儿童医院暨南京医科大学附属南京儿童医院，是一所集医疗、康复、保健、预防、科研、教学为一体的三级甲等儿童医院，是历史悠久、综合实力最强的大型儿童专科医院之一。
医院现有职工1150余人，其中高级专家148人，7人享受国务院特殊津贴，20余人为硕士生导师，40余人在国家级及省市级学术机构中担任学术职务。
医院专科齐全，涵盖儿童医疗各个领域，其中小儿心胸外科、新生儿医疗中心、呼吸科为省重点专科，小儿心血管内科、小儿肾脏科及小儿外科为市重点专科，并设有江苏省新生儿急救与低出生体重儿干预中心、南京中美儿童先心病研究中心、南京市脑瘫儿童康复技术指导中心、南京市儿科医学研究所、南京医科大学及南京大学儿科医学硕士点、省儿科医师进修基地。
医院技术全面，已开展许多世界前沿的先进诊断、诊疗技术和高难度手术，专科特色、专科优势已经形成。心胸外科每年先心病手术已超过600例，总例数已达7000例。新生儿医疗中心每年收治危重新生儿3900余例，抢救成功率及新生儿缺血缺氧性脑病的治疗处于全国先进水平。各临床专科技术全面发展，例如：脑外科儿童颅脑肿瘤手术及头颅畸形手术；骨科儿童髋关节病诊治及介入治疗股骨头无菌性坏死；泌尿外科儿童尿道下裂及肾移植手术；普外科儿童腹腔镜手术；新生儿外科微创手术及联体儿分离手术；整形外科新生儿唇腭裂同期修复手术；呼吸科婴幼儿纤支镜诊疗及哮喘防治；肾科血液透析滤过及血浆置换技术；心内科儿童先心病介入治疗；消化科儿童纤维胃镜及胃肠起博治疗；神经内科儿童癫痫的诊断治疗；血液科儿童白血病的治疗，风湿免疫科儿童类风湿性关节炎的早期诊断、早期治疗、发热待查的确诊率、川畸病的早期诊断、早期治疗；康复儿保科脑瘫儿童的早期诊断、早期治疗；急诊科危重病儿的抢救及院前急救技术；麻醉科低龄婴幼儿麻醉技术；药剂科小儿自制药品等已形成独具特色的品牌优势。耳鼻咽喉科气管异物取出7000余例；小儿眼科、小儿口腔科、小儿中医科独具匠心。
医院坚持“科技兴院”的办院方针，每年均有多项课题获省、市科技进步奖，年发表论文160余篇，现有40余项国家、省、市级立项科研课题。医院坚持“以病人为中心”，不断改进服务模式，多次获得南京市“十佳医院”、“南京市文明单位”等荣誉称号。
医院还与美国、加拿大等国的同行签订友好交流协议书，定期进行学术交流与合作，不断提高学术、诊疗水平。
医院拥有适合儿童的高档16排螺旋CT、DSA、数字化胸片机、彩色多普勒超声诊断仪、人工心肺机，全自动生化分析仪、全自动血球计数仪、微量元素检测仪等大型设备，为临床诊断和治疗提供了重要保证。现代化门诊楼及急诊输液中心为就医者提供了舒适的诊疗环境。
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