门诊常用的检查是彩超，明确结石的部位、多少，有无肾脏积水。尿常规检查，明确是否有感染和血尿，如有感染需要做尿培养和药敏实验，如有细菌生长，可以根据药敏结果，有针对性的选用抗生素。若患者发热需要进行血常规及C反应蛋白、降钙素原等检查，明确感染的严重程度。
复杂性结石或者需要进一步治疗的肾结石，还需要KUB、肾、输尿管、膀胱的X线平片、静脉肾盂造影、CT等检查，可更直观的观察结石的位置、肾脏结构特点、有无肾盂积水等，还可大概评估肾脏功能。结合各项检查结果，确定具体的手术方案，有无继发性结石的可能。
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