病毒性脑膜炎的脑脊液特点与细菌性脑膜炎、结核性脑膜炎、真菌性脑膜炎都不同。
细菌性脑膜炎脑脊液，外观浑浊，细胞数明显增高，一般在1000以上，以多核细胞为主。结核性脑膜炎的脑脊液外观微黄、静置时可以出现薄膜，细胞数一般不超过500，也以多核细胞为主。生化检查时糖、氯化物减低、蛋白质增高，做PPT试验是阳性，脑脊液里能查到抗酸杆菌。而真菌性的脑脊液外观上没有特殊不同，生化检查也与病毒类似，但有一个特点，是墨汁染色时会发现隐球菌，可以确定为真菌感染。
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