从目前来看，红斑狼疮的病因还不是很明确，目前认为是自身免疫性疾病，目前认为与下列因素有关：
一、遗传因素。一部分病人有家族的发病史，患者亲属里面，例如孪生姐妹、母女等，从患本病的机会更多。
二、环境因素。狼疮常在以下因素中发病，或病情恶化：1.例如病毒感染，主要是慢病毒。2.日光及紫外线的照射。3.性激素的水平。红斑狼疮的发病生育期女性是占多数的，提示收入群体内雌激素水平对狼疮发病起着重要的作用。4.药物。有些药物是半抗原进入狼疮患者体内，可以诱发免疫应答，诱发红斑狼疮。
另外免疫反应的异常包括免疫失调，T细胞、B细胞的功能的失调等等，都可以引起免疫功能的异常，引起系统性红斑狼疮的发病。红斑狼疮的病因不是很清楚，发病因素是多种多样的。因此得了系统性红斑狼疮一定要早期诊断，早期治疗。
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