临床上常用甲型流感病毒的抗原检测阳性，或甲型流感病毒的核酸检测阳性作为确定诊断的依据，甲型流感病毒抗原检测的优点是检测速度比较快，不足之处是敏感度比核酸检测低。如果患者甲型流感病毒抗原检测阴性，要同时对患者的呼吸道标本进行核酸检测，抗原检测阴性不能完全除外甲型流感。
所以甲型流感病毒核酸检测的敏感性和特异性要比抗原检测要高。
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