尿路感染的主要依据为尿液的炎症改变及病原学检查，其次为临床表现及各项辅助检查。尿中白细胞增多，每高倍视野常在5个以上。少数患者起病初可出现血尿。尿中出现白细胞管型和尿蛋白明显增多者提示肾盂肾炎。当清洁中段尿培养有>105/ml细菌生长时可确诊为尿路感染，<104/ml大多系污染。无法留取标本的老年人、婴幼儿或截瘫患者可采用耻骨上膀胱穿刺留尿，有细菌生长时即为感染。培养阳性者应即进行药敏试验。
(一)尿路感染
1.正规清洁中段尿(要求尿停留在膀胱中4～6h以上)细菌定量培养，菌落数≥105/ml.
2.参考清洁离心中段尿沉渣白细胞数≥10个/HP，或有尿路感染症状者。
具备上述1、2可以确诊。如无2则应再作尿菌计数复查，如仍≥105/ml，且两次的细菌相同者，可以确诊。
3.作膀胱穿刺尿培养，如细菌阳性(不论菌数多少)，亦可确诊。
4.作尿菌培养计数有困难者，可用治疗前清晨清洁中段尿(尿停留于膀胱4～6h以上)正规方法的离心尿沉渣革兰染色找细菌，如细菌>1/油镜视野，结合临床症状，亦可确诊。
5.尿细菌数104～5/ml之间者，应复查，如仍为104～5/ml，需结合临床表现来诊断或作膀胱穿刺尿培养来确诊。
(二)上、下尿路感染的鉴别具备上述尿路感染标准兼有下列情况者：
1.尿抗体包裹细菌检查阳性者，多为肾盂肾炎，阴性者多为膀胱炎。
2.膀胱灭菌后的尿标本细菌培养结果阳性者为肾盂肾炎，阴性者多为膀胱炎。
3.参考临床症状，有发热(>38℃)或腰痛，肾区叩击痛或尿中有白细胞管型者，多为肾盂肾炎。
4.经治疗后症状已消失，但又复发者多为肾盂肾炎(多在药后6周内);用单剂量抗菌药治疗无效或复发者多为肾盂肾炎
5.经治疗后仍留有肾功能不全表现，能排除其它原因所者;或X光肾盂造影有异常改变者为肾盂肾炎。
(三)急、慢性肾盂肾炎的鉴别
1.尿路感染病史在一年以上，经抗菌治疗效果不佳，多次尿细菌定量培养均阳性或频繁复发者，多为慢性肾盂肾炎。
2.经治疗症状消失后，仍有肾小管功能(尿浓缩功能等)减退，能排除其他原因所致者为慢性肾盂肾炎。
3.X线造影证实有肾盂肾盏变形，肾影不规则甚至缩小者为慢性肾盂肾炎。
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