虽然脊髓室管膜瘤与脊髓实质的边界相对清晰，但是对手术操作的要求还是比较高的，手术之后也是有一定风险的。
因为这类肿瘤需要切开脊髓，沿着肿瘤与脊髓的正常边界来切除肿瘤，所以在手术之后有可能会造成患者术前原有神经功能障碍的加重，特别是在术后短时间内，由于脊髓的水肿等原因，患者术前的神经功能障碍在术后可能会有所加重。此外，患者还有可能在手术之后出现肿瘤所在平面以下的感觉、运动和括约肌功能障碍。
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