口服抗生素可以杀灭细菌，减缓菌斑的再聚集。特别是针对于急性感染，或者合并糖尿病、HIV感染、风湿性心脏病等全身疾病时，使用抗生素，可以有效缓解急性炎症、控制感染、预防并发症。但是由于牙菌斑生物膜结构的特殊性，使其对抗菌药物有较强的抵抗力，所以必须结合临床的治疗，在医生的指导下选择和使用。
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