羊水抽取术一般会安排在怀孕周数15～18周之间。因为这个时候子宫够大了，羊水够多了，技术上比较容易一些。如果更早一点想知道染色体的情况，可以考虑‘绒毛膜采样’。
抽羊水实际操作时，孕妇平躺在检查台上，不必麻醉。先做个腹部超音波，确认胎儿的心跳正常、周数大小符合、胎盘位置适宜、羊水分布适宜、是否有明显胎儿异常，以上一切都没问题后，就可以选定一处腹部，做为待会儿下针的位置。
接着开始消毒孕妇的腹部，换穿无菌手套及衣服。一切准备就绪后，就一边看着超音波的影像，一面由肚皮下针。针尖会穿过孕妇的肚皮、肌肉、子宫，最后进入羊膜腔内有羊水的地方。一般抽取约15～20㏄的羊水后，针头就抽回出体外，顺利的话，5分钟内就完成抽取的步骤。少数情况下，第一次抽不到羊水，必须再抽一次。只有当针刺入皮肤的时候会痛，抽完以后，会再次确认胎儿心跳正常，原来的扎针之处覆盖一小块胶布，就完成整个步骤。
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